在赣西，由第3军和第2军主力占领萍乡后，连克宜、万载、分宜，在新喻与孙大帅麾下的直军一激战三昼夜占领该地后，第3军向安、第2军主力向樟树方向击。在赣西北，第6军和第1军第1师分别克修、铜鼓，继占奉新和安。9月19日，第6军第19师乘虚攻占南昌城。孙大帅急从南浔铁路沿线和樟树地区调兵反击。由奉新向南昌攻击前的第1军第1师在行受挫，伤亡甚重。第19师孤军苦战三日后，被迫于21日退南昌。次日，第19师得本军第17师增援，再次攻南昌，又遭直军优势兵力围攻，遂于23日突围，撤向奉新地区。

第8军于8月26日开始在临湘、嘉鱼间陆续渡过长江，9月5日向汉发起攻击。直军湖北暂编第2师倒戈，改编为国民革命军第十五军，合第8军作战，6日攻占山。第8军第2师攻占汉兵工厂，第4师占领汉城。7日，第8军第2师渡过汉，攻占汉。吴大帅率残北逃。第8军主力乘胜追击，至16日相继占领武胜关、平靖关、公山和九里关。国民革命军攻占汉、汉后，武昌已成孤城。

敌，突破直军桃林铺防线，向贺胜桥发展攻。第7军攻占王本立后，迅即向贺胜桥东侧的南桥攻击。直军正面失利，侧背受敌，全线动摇，纷纷溃退。国民革命军于当日上午占领贺胜桥，俘敌3500余人，中路第四，第七、第八军主力全线击破汨罗江直军防线，继在汀泗桥、贺胜桥打败直军主力，围武昌，一绕攻克汉、汉，前锋追武胜关。吴佩孚迅速集结兵力，企图凭借长江、汉固守武汉。署以陆军第3、第8师和第25师等守备武昌；陆军第14师守备汉、汉；另以湘军残在沌、金，武卫军和河南第10师在逻、黄冈，湖北暂编第2师和河南暂编第2师在蔡甸、沙洋，第13混成旅、浚游击队等在汉附近地区，保障武汉的安全。国民革命军于9月1日包围武昌城。2日，前敌指挥决定以第4军并属第1军第2师和第7军第7、第8旅主攻武昌城；第8军继续准备攻汉、汉；第7军第1、第2旅在鄂城、樊遮断直军长江通，掩护攻城队侧背安全；第1军第1师为总预备队，在崇待命。由于武昌城墙筑，直军防守严密，攻城队在缺乏周密准备的情况下，先后于3日、5日两次攻城，均未奏效，且伤亡甚重，遂对武昌改取封锁围困。

9月中旬，第7军和第1军第2师奉调赣作战，由第4、第15军和第8军一继续封锁围困武昌。10月8日，守军第3师师长率投诚。10日，攻城队在吴投诚队接应下攻占武昌城，歼敌2万余人，生擒守城司令、第8师师长。正当国民革命军席卷湘、鄂，吴大帅军队濒于崩溃之际，孙大帅于8月25日在南京召开军事会议,决定从苏、浙、皖调兵10万赣，会同其驻赣队2万余人攻湘、鄂；并令福建督理袭广东，威胁国民革命军后方。国民革命军总司令为达到占领江西的预定目标，决定对江西转取攻势。

在此期间，孙大帅将其在赣、闽的队编组为5个方面军，并设司令于九江，亲自坐镇指挥，计划以一路反攻南昌后，由安方向击长沙；一路由武宁越过九山攻取湖北通山；一路由武渡江攻新，在咸宁、蒲圻间截断武昌至长沙铁路，然后北上解救武昌。

9月上旬，国民革命军分三路军江西。在赣南，第2军第5师、第5军第16师第46团和第14军先于其他方向行动，攻占赣州后沿赣江北上，向吉安方向发展攻。